养济院的管理机构临时是卫生署所辖，朱由检打算将来卫生署升格后，再单独将后世的民政部门分离出来，专门从事扶助老弱的社会福利机构，由于人员紧缺的状况，所以现在暂时归属卫生署。
在京师中，相同性质的养济院共设有四处，其中一处专门收容女性，管理者也全是女性，其余三处为男性，这也是为了方便管理，避免出现有伤风化事件所采取的方式。
每一处养济院都设有两处大型灶间，两座一次可容纳两百人同时就食的食堂，被收拢的人员都有自己专用的木质餐具，这样可以有效避免疫病的传染。
养济院中还设有公共澡堂四处，由于条件所限，澡堂没有那种大型浴池，只是备制了竹管做成的淋浴器，春夏秋三季，利用放置在屋顶、里面蓄满水的铁皮桶接收太阳直射后的加温效果，供被养济者使用，冬季则是制备了数百个木桶供人沐浴。
在设计这些个人卫生设施时，工部的官员没少发牢骚，认为皇帝是钱太多烧的，根本没必要给这些毫无用处的人员提供这么好的设施，只要管着他们吃饭就已经是大发慈悲了。
谁知道他们这些私下的牢骚被锦衣卫侦知后传入宫里，朱由检听说后大发脾气，一气之下命令锦衣卫把那几个说怪话的官吏按在地上打了二十大板，从那以后再也没有怪话出现，都是老老实实地按照皇帝的吩咐严格执行。
由于人员太多的缘故，养济院中还建起了十余座公厕，直接废除了原先使用便桶在房间内方便的恶习，这就使得整体的环境变得更加良好起来。
院内还有诊室两座，常年备有治疗风寒发热、腹泻伤寒等症状的汤药，每座诊室都设有郎中一人，学徒四人，以供被养者能够及时就医。
当然，药医不死病，这种措施更多的是给人一种心理上的安慰，依照现时的医疗水平，如果真是患了急症，没有现代西医手段的郎中也是束手无策。
张立用所在的养济院雇佣了各种杂役数十人，这些受雇者根据从事劳作的不同，所领取的月俸也不一样，但最低的每月也有七钱银子，一年下来也有八两多银子的收入，还能省去两顿饭钱，这就是纯收入了。
这些受雇人员都是住在养济院周边的京师本地人氏，有男有女，他们在从事完一天的劳作后就可以下值回家，这种职业已经是相当不错了。
京城四所养济院所耗的银钱全部由內帑所出，每年每所养济院大约消耗三万余两银子，这十几万两银子对于现在的朱由检来说不值一提，他更在意的是通过这种举动，向整个社会传达一种