缺乏的士卒数量通过总督上报兵部，由兵部与都察院派遣官员到各地和卫所中招募士卒，随后在九边三大防区设立练兵处，负责新兵的训练、分配，练兵处直接对朝廷的练兵军务处负责，由练兵军务处负责选派将领，训练新兵，待考核完成之后，按照数量分配到各镇、协、营。