逼得上天无路，入地无门，便投了三理教杨如仙。
真要论本事，杨如仙也不是黄元君的对手。不过三理教在川中势力庞大，盘根错节，把卓玄道藏起来没有问题。
得了三理教的掩护，卓玄道才算躲过黄元君的追杀。后来听说黄元君杀卓玄道不成，又去杀计过真。计过真逃到魔都避难，躲进了宪兵总部，但终究还是死在了黄元君手下。
因此卓玄道对杨如仙感恩戴德，传了杨如仙许多外道法门，可杨如仙不满意还想要高天观的正传秘法，尤其是据说修成可以立地成仙的宝胎丹元术。
卓玄道被逼得急了，便找借口想脱离三理教。杨如仙识破了卓玄道的打算，也怕把他逼急了生出事端，便同意卓玄道离开，只是要求卓玄道去灭了纯阳宫。
杨如仙的三理教能够在川中迅速发展，其实是得到了纯阳宫的暗中支持，但发展壮大之后，便一直对纯阳宫不停索要财物供奉感到不满，想要摆脱纯阳宫自立，只是忌讳纯阳宫道人的本事，不敢轻举妄动。